近日，蘭州大學(xué)第一醫(yī)院與真邁生物在BMC Medical Genomics雜志合作發(fā)表了題為“Fraternal twins with Phelan-McDermid syndrome not involving the SHANK3 gene: case report and literature review”的研究論文。研究展示了一項(xiàng)基于真邁生物GenoCare測序平臺開展的染色體疾病Phelan-McDermid綜合征案例分析，通過單分子測序發(fā)現(xiàn)了與該染色體異常相關(guān)的新的致病基因。

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該研究中的病例是一對7歲異卵雙胞胎，二人均具有智力殘疾、嚴(yán)重語言發(fā)展障礙、行為異常等臨床表現(xiàn)，在5歲時(shí)診斷為Phelan-McDermid綜合征。最初采用的遺傳分析手段是串聯(lián)質(zhì)譜和核型分析，但都沒有得到任何可靠的結(jié)果，隨后進(jìn)行CNV-seq檢測發(fā)現(xiàn)在22號染色體的22q13.31-22q13.33區(qū)間存在一段雜合的缺失，男孩和女孩的染色體分別存在一段6.36Mb和6.34Mb的缺失區(qū)域。

Phelan-McDermid綜合征又名22q13缺失綜合征，主要的臨床表現(xiàn)包括智力殘疾、全面發(fā)展延遲、肌張力低下、自閉癥譜系障礙、顱面部畸形等，是由于染色體22q13區(qū)域缺失而導(dǎo)致的一種染色體缺失綜合征。SHANK3基因被認(rèn)為是與該病最密切相關(guān)的致病基因。?

為獲得更精確的染色體異常情況，本研究采用單分子基因測序平臺GenoCare 1600對這兩名患者以及他們的父母進(jìn)行染色體異常的檢測，采集外周血后進(jìn)行測序。測序結(jié)果顯示，兩名患者具有一個(gè)完全相同的缺失位點(diǎn)，是一段6Mb的雜合缺失（圖1），而他們的父母在該位點(diǎn)則是正常的，表明這是一個(gè)新發(fā)突變（de novo mutation）。在這6Mb的缺失區(qū)域中，包含了45個(gè)蛋白編碼基因但卻不包括SHANK3基因。此外，在其母親的同一條染色體上檢測到了一個(gè)小的0.6Mb的缺失（圖2）。

圖2：GenoCare 1600檢測結(jié)果（患兒母親）

該研究中，兩名患兒的染色體異常均源于胚胎，可能以嵌合的形式存在，通過傳統(tǒng)的方法無法很好地進(jìn)行產(chǎn)前診斷，而已有的一些研究顯示，基于單分子基因測序儀的檢測體系對低至20%的胚胎異常嵌合可成功檢出，因此更高精度的檢測技術(shù)有望在產(chǎn)前實(shí)現(xiàn)胚胎的染色體疾病檢測，使得染色體疾病可以更早的被發(fā)現(xiàn)，早發(fā)現(xiàn)早應(yīng)對早治療。

相比于核型分析、CMA等傳統(tǒng)檢測手段，單分子基因測序平臺GenoCare 1600進(jìn)行分析能獲得更精確的檢測結(jié)果，更快速地發(fā)現(xiàn)遺傳病相關(guān)的致病位點(diǎn)，輔助診斷與治療。