11月28日,我們發(fā)布了第三款基因測序產(chǎn)品FASTASeq?300,FASTASeq?300極簡靈活、極速交付的特點能夠很好地滿足病原微生物的檢測需求。近期,我們與諾禾致源聯(lián)合開展了FASTASeq?300病原微生物檢測性能的測評工作,測評結(jié)果顯示,FASTASeq?300表現(xiàn)優(yōu)異,其單Lane單樣、Pooling上樣兩種模式和GenoLab?M在致病菌檢測結(jié)果上一致性達100%。
本次聯(lián)合測評,諾禾致源選用了8種不同類型的臨床樣本來制備宏基因組文庫,制備的文庫分別在GenoLab M和FASTASeq 300上進行SE50測序。FASTASeq 300四流道芯片支持靈活的分Lane加載樣本,因此,基于FASTASeq 300開展“單Lane單樣本(FASTASeq 300 0 index)測序”和“Pooling 混樣(FASTASeq 300 8+8 Dual index)測序”。以上三種測試方式共產(chǎn)生27份下機數(shù)據(jù),均由諾禾致源進行分析評估。
測評結(jié)果
FASTASeq 300 & GenoLab?M樣本微生物組成與相對豐度結(jié)果
在測試樣本中挑選微生物含量較高且組成較豐富的4例臨床樣本進行微生物組成展示(相對豐度TOP 10),GenoLab M和FASTASeq 300單Lane單樣/Pooling上樣測序方式檢出的TOP10微生物物種組成和豐度分布一致性高。
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?圖1. 肺泡灌洗液(S1550)樣本不同測序方式檢測結(jié)果? ? ? ? ? ? ?圖2. 肺泡灌洗液(S1553)樣本不同測序方式檢測結(jié)果
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 圖3. 尿液(S1555)樣本不同測序方式檢測結(jié)果? ? ? ? ? ? ? ? 圖4. 手術(shù)組織(S1556)樣本不同測序方式檢測結(jié)果
測評結(jié)果
致病微生物判讀結(jié)果
GenoLab M和FASTASeq 300單Lane單樣/Pooling上樣測序方式的致病菌檢測結(jié)果一致性達100%。
圖5. 不同測序方式下的樣本致病菌檢測結(jié)果(RPM)
*?為了使物種檢出數(shù)據(jù)在不同平臺、不同樣本間具有可比性,基于RPM(Reads per million mapped reads)對下機數(shù)據(jù)進行均一化處理。
FASTASeq 300具有極簡靈活、極速交付的特點,用戶可根據(jù)檢測場景需求靈活調(diào)整測序策略。本次聯(lián)合測評驗證了FASTASeq 300的極速測序和穩(wěn)定的致病菌檢出能力。FASTASeq 300將為病原檢測應(yīng)用提供強有力的國產(chǎn)平臺支撐。
基于多年在測序技術(shù)上的探索與創(chuàng)新積累,真邁生物完成多款基因測序系統(tǒng)的研發(fā)制造和商業(yè)化。未來,真邁生物將一如既往地秉承以用戶為中心,與合作伙伴共同推動測序技術(shù)在基因檢測領(lǐng)域的應(yīng)用,進一步實現(xiàn)基因檢測全流程國產(chǎn)化,為科研用戶及臨床工作者提供更便捷、更靈活、更精準的核心工具。