? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ◆?快:9小時即可完成核酸樣本的建庫及SE75 Dual Index測序
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ◆?準(zhǔn):在超高人源核酸背景下,含量低至0.01%的細(xì)菌與病毒均可準(zhǔn)確檢出
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ◆?穩(wěn):10 ng~1000 ng的核酸均可實現(xiàn)成功建庫、穩(wěn)定測序
【?測試方案?】
樣本組成:為更好地模擬感染樣本真實組成,使用293細(xì)胞 Total RNA 模擬人源核酸背景,按0.1%和0.01%的比例摻入等量細(xì)菌(Sau1)和病毒(PEDV2、PRRSV3)的RNA。
表1. 樣本組成
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??建庫試劑盒:TruePrep??RNA Library Prep Kit(TR501-503)
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??測試平臺:FASTASeq 300、NovaSeq 6000
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??分析策略:每個樣本抽取SE75 20M reads用于后續(xù)分析
【?測試結(jié)果?】
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?■?FASTASeq 300測序數(shù)據(jù)質(zhì)量表現(xiàn)優(yōu)異,平均Q30>93%。
圖1. 不同樣本在FASTASeq 300和NovaSeq 6000平臺測序質(zhì)量表現(xiàn)
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?■?FASTASeq 300病原微生物檢出性能優(yōu)異,與NovaSeq 6000檢出水平相當(dāng)。
圖2. 0.1%~0.01%細(xì)菌(Sau)檢出水平
圖3. 0.1%~0.01%病毒(PEDV和PRRSV)檢出水平
【?產(chǎn)品介紹 】
建庫試劑盒:諾唯贊重磅推出轉(zhuǎn)座酶RNA建庫試劑盒——TruePrep RNA Library Prep Kit(Vazyme #TR501-TR503),可快速高效建庫,為mNGS的快速檢測提供新方案。該產(chǎn)品采用新型的轉(zhuǎn)座酶法對RNA/cDNA雜合鏈片段化,將繁瑣的RNA片段化、二鏈合成、末端修復(fù)、dA-Tailing和接頭連接等步驟轉(zhuǎn)變?yōu)橐徊胶唵蔚拿复俜磻?yīng)。
圖4. TruePrep RNA Library Prep Kit建庫流程與常規(guī)試劑盒流程對比
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?◆?建庫耗時短:超快速的RNA建庫流程,建庫時長縮短至2h
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?◆?微生物檢出靈敏度高:可檢出低至0.01%占比的微生物
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?◆??嚴(yán)格的背景菌質(zhì)控:低背景菌殘留
【?訂購信息 】
Sau1:Staphyloccocus Aureus,金黃色葡萄球菌;
PEDV2:Porcine epidemic diarrhea virus,豬流行性腹瀉病毒;
PRRSV3:Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,豬繁殖與呼吸綜合征病毒。