全基因組甲基化測序文庫（WGBS）的堿基比例嚴(yán)重失衡（GC%～20%），這給高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)交付帶來了極大的挑戰(zhàn)。通常，我們采用摻入高比例的專用平衡文庫（例如PhiX文庫、E.coli文庫）或與GC含量40%～50%的其他應(yīng)用樣本Pooling測序的方法來緩解失衡，提高測序質(zhì)量。然而，這種方法不僅降低了生產(chǎn)效率，還增加了測序的成本和操作的復(fù)雜性。
真邁生物高通量基因測序儀全系產(chǎn)品已實現(xiàn)“甲基化0%平衡文庫摻入”高質(zhì)量測序。本次測試中，在0% PhiX平衡文庫摻入的條件下，Q30均值≥92%、單index測序數(shù)據(jù)拆分率均值≥98%，與跟堿基平衡文庫混合測序的NovaSeq 6000平臺數(shù)據(jù)表現(xiàn)相當(dāng)。
【測試方案】
【測試結(jié)果】
（1）Q30均值達(dá)92%以上、單index 測序數(shù)據(jù)拆分率均值達(dá)98%以上
圖1A. FASTASeq 300_0% PhiX重復(fù)測序表現(xiàn)
圖1B. GenoLab M_0% PhiX重復(fù)測序表現(xiàn)
圖1C. SURFSeq 5000_0% PhiX重復(fù)測序表現(xiàn)
（2）數(shù)據(jù)比對表現(xiàn)優(yōu)異，達(dá)80%以上
圖2A. FASTASeq 300和GenoLab M平臺重復(fù)測序的Mapping Rate
圖2B. SURFSeq 5000重復(fù)測序的Mapping Rate
（3）甲基化類型和分布水平表現(xiàn)均高度一致
圖3A. 不同甲基化類型的比例
圖3B. 全基因組CG位點甲基化水平分布
真邁生物通過技術(shù)優(yōu)化升級，全系產(chǎn)品實現(xiàn)了“甲基化0%平衡文庫摻入”高質(zhì)量測序。這一技術(shù)突破，進(jìn)一步增強(qiáng)了真邁生物測序儀的產(chǎn)品力，為廣大用戶提供更為高效、經(jīng)濟(jì)的測序平臺工具。
【真邁生物高通量測序儀產(chǎn)品介紹】
歡迎聯(lián)系技術(shù)支持，了解升級詳情！
撰稿：崔青美
編輯：市場部