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真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案
時間:
2024-07-11
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真邁生物與專注于單細胞技術(shù)服務(wù)的尋因生物開展深度合作,雙方整合技術(shù)資源優(yōu)勢,共同打造了高質(zhì)量的國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案,該方案將為推動單細胞技術(shù)應用和發(fā)展提供強有力的支持。


雙方合作開展了單細胞整體解決方案的性能評價工作,評價采用了尋因生物單細胞免疫組試劑盒構(gòu)建了多物種多組織樣本單細胞文庫,文庫樣本同時在SURFSeq 5000和NovaSeq 6000測序平臺進行測試分析。


結(jié)果顯示,SURFSeq 5000在Clean bases ratio以及單細胞文庫質(zhì)控中的多項指標均表現(xiàn)出色,其各樣本獲得read數(shù)、識別細胞數(shù)以及細胞中位基因數(shù)等指標均優(yōu)于NovaSeq 6000。



測試方案



表1 測試方案

真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案



測試結(jié)果



?下機數(shù)據(jù)質(zhì)量高,Clean bases ratio表現(xiàn)更優(yōu)

真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案

圖1 下機數(shù)據(jù)對比


?單細胞轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)控結(jié)果優(yōu)異,且各樣本獲得read數(shù)、識別細胞數(shù)、每個細胞中位基因數(shù)等方面表現(xiàn)更優(yōu)

表2?單細胞轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)控對比結(jié)果

真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案


?共享cell barcode高達97%

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圖2 共享cell barcode對比結(jié)果


?高變基因相關(guān)性高達99%

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圖3 高變基因相關(guān)性對比結(jié)果

注:每個點表示一個細胞表達基因分別在SURFSeq 5000 和 NovaSeq 6000平臺中的 UMI counts 分布。


?所有基因表達量相關(guān)性達90%以上

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圖4 所有基因表達量相關(guān)性對比結(jié)果


?平臺間一致性高

真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案

圖5 細胞注釋一致性對比結(jié)果



真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案
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真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案

圖6 細胞聚類對比結(jié)果


真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案

圖7 各cluster中細胞比例結(jié)果


真邁生物與尋因生物聯(lián)手打造的國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案展現(xiàn)出了優(yōu)異的性能與可靠性,該方案可為科研人員提供高質(zhì)量的單細胞組學數(shù)據(jù),成為推動大規(guī)模單細胞測序深入研究的重要工具。



產(chǎn)品介紹



尋因單細胞免疫組產(chǎn)品



尋因單細胞免疫組庫產(chǎn)品,立足尋因生物卓越的研發(fā)創(chuàng)新能力和品控工藝水平致力于提供行業(yè)精準數(shù)據(jù)產(chǎn)出和全流程技術(shù)服務(wù),助力免疫細胞的分化、發(fā)育和免疫識別等功能研究,在腫瘤免疫治療、感染性疾病、自身免疫疾病和疫苗/抗體研究等領(lǐng)域具有廣泛的應用前景。以我所專,助您所研。


真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案

*尋因單細胞免疫組庫產(chǎn)品詳情敬請關(guān)注尋因生物官網(wǎng)https://www.seekgene.com/


真邁生物SURFSeq 5000



SURFSeq 5000應用廣泛,速度快,質(zhì)量優(yōu),成本省。它以桌面儀器成本、小樣本數(shù)量開機成本實現(xiàn)了與大型機器相媲美的高通量測序價格。真邁生物致力于持續(xù)滿足行業(yè)對測序優(yōu)化的需求,與合作伙伴深度合作,為前沿科研探索和精準醫(yī)療提供強有力的支持。


真邁生物+尋因生物:打造高質(zhì)量國產(chǎn)單細胞組學整體解決方案





更多關(guān)于單細胞文庫質(zhì)控參數(shù)意義解讀可通過以下連接了解:

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