FASTASeq?300測(cè)序儀已實(shí)現(xiàn)“甲基化0%平衡文庫(kù)摻入”高質(zhì)量測(cè)序，這意味著在不摻入專用平衡文庫(kù)的條件下，F(xiàn)ASTASeq 300依然能夠提供高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。在0%PhiX平衡文庫(kù)摻入的條件下，Q30均值≥92%、單index測(cè)序數(shù)據(jù)拆分率均值≥98%，與跟堿基平衡文庫(kù)混合測(cè)序的進(jìn)口測(cè)序平臺(tái)數(shù)據(jù)表現(xiàn)相當(dāng)。

FASTASeq 300整體特點(diǎn)如下：

當(dāng)前傳統(tǒng)酶轉(zhuǎn)甲基化建庫(kù)技術(shù)運(yùn)用在cfDNA上時(shí)，會(huì)出現(xiàn)越靠近插入片段3'端的平均甲基化率越下降的缺陷。竹石生物的酶轉(zhuǎn)建庫(kù)方法采用優(yōu)化后的專利建庫(kù)流程和酶轉(zhuǎn)反應(yīng)體系，確保了cfDNA片段從頭到尾都保持一致的甲基化率，實(shí)現(xiàn)了甲基化狀態(tài)的高保真。

Reads各位置的甲基化率

竹石生物酶轉(zhuǎn)WGMS相比傳統(tǒng)鹽轉(zhuǎn)WGBS，在相同測(cè)序量下對(duì)基因組不同區(qū)域的覆蓋深度更加均勻，并能覆蓋到更多的CpG位點(diǎn)。在相同測(cè)序量下，酶轉(zhuǎn)WGMS檢測(cè)到的CpG位點(diǎn)數(shù)比鹽轉(zhuǎn)WGBS多10%~20%左右，尤其在CpG島、啟動(dòng)子區(qū)等GC富含區(qū)優(yōu)勢(shì)明顯。對(duì)全基因組以及甲基化檢測(cè)的重點(diǎn)區(qū)域的有效覆蓋深度，酶轉(zhuǎn)WGMS也遠(yuǎn)超WGBS。

基因組不同GC含量區(qū)域的有效覆蓋深度

具有不同覆蓋深度的CpG位點(diǎn)數(shù)量分布

測(cè)序數(shù)據(jù)中的Duplication可能來自建庫(kù)過程中的PCR擴(kuò)增以及測(cè)序過程中的光學(xué)重復(fù)。在將測(cè)序Reads比對(duì)到參考基因組之后，這些Duplication reads會(huì)作為冗余數(shù)據(jù)被去除掉。該甲基化整體解決方案顯示，在相同文庫(kù)相同測(cè)序量的情況下，真邁生物FASTASeq 300測(cè)序儀的Duplication rate顯著低于A公司的競(jìng)品測(cè)序儀結(jié)果，可以獲得更多的有效數(shù)據(jù)量。

Duplication rate對(duì)比

FASTASeq?300測(cè)序儀靈活的測(cè)序策略、用戶友好及高度自動(dòng)化的測(cè)序操作、快速的測(cè)序速度等特性表現(xiàn)突出，為用戶節(jié)省了項(xiàng)目周轉(zhuǎn)時(shí)間，減少了操作失誤，深得竹石生物用戶的認(rèn)可。竹石生物已基于真邁生物測(cè)序平臺(tái)面向高校、科研院所和企業(yè)開展了多物種各種樣本類型的甲基化測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序等科技服務(wù)。相信竹石生物與真邁生物的合作，將為甲基化研究帶來新的視角和工具。